El sistema de información HERMES fue creado en el 2005, y en el 2007 fue adoptado como sistema para la recopilación de información sobre las actividades de investigación en la Universidad, por medio de la Resolución 013 de 2007 de la Vicerrectoría de Investigación, en donde se estableció que todo proyecto de investigación debía ser ingresado al sistema Hermes por parte del docente líder del proyecto, y donde en se definieron unos roles específicos.
En el año 2014, mediante la Resolución 09 de 2014, se adoptó el sistema de información HERMES para la gestión de proyectos de extensión en la Universidad Nacional de Colombia.
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